Cây phát sinh víi các nhánh cành là biểu đồ giả thiết về mức độ tiến hoá của sinh vật. Sự hiểu biết càng ngày càng sâu của các nhà phân loại đã luôn luôn xem xét và cải tiến cây phát sinh cho phù hợp víi thực tế khách quan. Trước đây các nhà phân loại chỉ phân chia sinh vật thành 2 giới là giới thực vật và giới động vật và quan niệm đó xuất phát từ thời Linnaeus và đã tồn tại hơn 200 năm. Nhưng những phát hiện ra các cơ thể vi sinh. | 51 Cây phát sinh víi các nhánh cành là biểu đồ giả thiết về mức độ tiến hoá của sinh vật. Sự hiểu biết càng ngày càng sâu của các nhà phân loại đã luôn luôn xem xét và cải tiến cây phát sinh cho phù hợp víi thực tế khách quan. Trước đây các nhà phân loại chỉ phân chia sinh vật thành 2 giới là giới thực vật và giới động vật và quan niệm đó xuất phát từ thời Linnaeus và đã tồn tại hơn 200 năm. Nhưng những phát hiện ra các cơ thể vi sinh vật như vi khuẩn tảo nấm . người ta xếp chúng vào giới thực vật thật ra chúng khác xa víi thực vật và từ năm 1969 nhà sinh thái học người Mỹ Whitaker đã đề nghị một hệ thống phân loại gồm năm giới five-kingdom system được đa số nhà phân loại công nhận. - Giới Monera có đặc điểm thuộc dạng tế bào Procaryota. Trong đó bao gồm vi khuẩn vi khuẩn lam và vi khuẩn cổ. - Giới Protista có đặc điểm thuộc dạng tế bào Eucaryota và đa số chúng thuộc cơ thể đơn bào nhưng cũng có một số thuộc cơ thể đa bào. Giới Protista bao gồm các nguyên sinh động vật Protozoa - là các cơ thể đơn bào không có lục lạp như trùng Amip trùng lông trùng roi trùng bào tử. Tảo Algae cũng thuộc Protista nhưng chúng có chứa lục lạp và quang hợp. Tảo - cơ thể đơn bào hoặc đa bào. - Giới nấm Fungi có đặc điểm là thuộc dạng tế bào Eucaryota không có lục lạp sống dị dưởng hoại sinh. - Giới thực vật Plantae có đặc điểm là thuộc dạng tế bào Eucaryota cơ thể đa bào có lục lạp sống tự dưởng quang hợp. - Giới động vật Animalia có đặc điểm là thuộc dạng tế bào Eucaryota cơ thể đa bào không có lục lạp sống dị dưởng xem hình . Hơn chục năm gần đây những nghiên cứu về phân loại học phân tử và phân tích phân nhánh cladistic analysis đã xem xét lại thuyết năm giới và đã đề nghị thuyết 3 lãnh giới three-domain system được xem như là một khâu để tiến tới hình thành sáu giới. Theo hệ thống 3 lãnh giới thì có 3 nhóm xuất phát cơ bản là - Lãnh giới vi khuẩn Bacteria thuộc dạng tế bào Procaryota. - Lãnh giới vi khuẩn cổ Archea thuộc dạng tế bào Procaryota nhưng có nhiều đặc trưng .
