Nghiên cứu tiến hành đánh giá và so sánh biểu hiện gen trên 62 mẫu mô từ bệnh nhân (BN) ung th- đại trực tràng (UTĐTT) đ-ợc xác chẩn qua sinh thiết sau phẫu thuật, trong đó có 39 mẫu mô ung th- và 23 mẫu mô tổ chức xa khối u. Tách chiết ARN tổng số từ mô ung th- và mô lành. cADN, ARN, đ-ợc tổng hợp, tinh sạch RNA sử dụng bộ kit Ambion Illumina TotalPrep ARN Amplification Kit theo quy trình của nhà sản suất. Lai cARN lên chip sử dụng Sentrix(R)BeadChip HumanRef-8_V2, Illumina, Mỹ, 22185. | NGHIÊN CỨU PHÁT HIỆN GIẢM ĐIỂU HOÀ GEN TRONG MỒ UNG THƯ ĐẠI TRỰC TRÀNG BẰNG CỒNG NGHỆ MICROARRAY Hoàng Văn Lương Triệu Tiến Sang Trần Văn Khoa Nguyễn Duy Bắc Lê Quang Minh TÓM TẮT Nghiên cứu tiến hành đánh giá và so sánh biểu hiện gen trên 62 mẫu mô từ bệnh nhân BN ung thư đại trực tràng UTĐTT được xác chẩn qua sinh thiết sau phẫu thuật trong đó có 39 mẫu mô ung thư và 23 mẫu mô tổ chức xa khối u. Tách chiết ARN tổng sô từ mô ung thư và mô lành. cADN ARN được tổng hợp tinh sạch RNA sử dụng bộ kit Ambion Illumina TotalPrep ARN Amplification Kit theo quy trình của nhà sản suất. Lai cARN lên chip sử dụng Sentrix R BeadChip HumanRef-8_V2 Illumina Mỹ 22185 gen. Rửa và phát hiện tín hiệu bằng Stepavidin-Cy3. Scan hình ảnh lai cARN trên chip của hệ thông trên hệ thông Illumina Bead array reader Bead Station 500X. Phân tích kết quả bằng phần mềm Beadstudio và phần mềm trực tuyến DAVID. So sánh biểu hiện gen được giữa các mẫu mô ung thư và mẫu mô xa tổ chức ung thư - mô lành. Kết quả phát hiện 43 gen giảm biểu hiện ở mô ung thư so với mô lành p 0 01 . Từ khóa Ung thư đại trực tràng Công nghệ microarray. STUDY ON DOWN-REGULATED GENES IN COLORECTAL CANCER TISSUE USING MICROARRAY TECHNOLOGY SUMMARY The study was carried out on 62 tissue samples including 39 tumor tissue and 23 normal tissue samples from colorectal cancer patients confirmed by biopsy analysis after operation. Total RNA were extracted from the 62 samples. cDNA RNA were syntherized and purified using Ambion Illumina TotalPrep RNA Amplification Kit according to manufactures procedure. cRNA were hybridized with oligonucleotide probes on Sentrix R BeadChip HumanRef-8_V2 Illumina USA 22185 genes. After washing signal was detected with Stepavidin-Cy3. Scanning and getting image carried out on Illumina Bead array reader Bead Station 500X. Analysis of the obtained data with Beadstudio and online DAVID sofware. The rerults showed 43 down-regulated genes in tumor tissues in comparision with the normal .
