Gần đây, virut Chikungunya (CHIKV) là một nguyên nhân gây ra dịch sốt xuất huyết (SXH) ở các n-ớc Đông Nam á và châu Phi. Mặc dù, xét nghiệm huyết thanh học có thể phát hiện nh-ng việc phát hiện CHIK-ARN trong mẫu bệnh phẩm vẫn cần đ-ợc phát triển, cải thiện. Nghiên cứu này, mô tả kỹ thuật RT-PCR khuếch đại gen E1 của virut dùng chẩn đoán CHIKV-ARN. Bằng kỹ thuật này phát hiện 4/50 (8%) bệnh nhân (BN) SXH d-ơng tính với CHIKV-ARN. Phân tích trình tự gen 4 mẫu này xác định độ t-ơng đồng các. | ỨNG DỤNG KỸ THUẬT RT -PCR PHÁT HIỆN VIRUT CHIKUNGUNYA ỏ BỆNH NHÂN SỐT XUẤT HUYÊT Nguyễn Trọng Viễn Vũ Xuân Nghĩa Nguyễn Lĩnh Toàn Trần Viết Tiên Lương Cao Đồng TÓM TẮT Gần đây virut Chikungunya CHIKV là một nguyên nhân gây ra dịch sốt xuất huyết SXH ở các nước Đông Nam á và châu Phi. Mặc dù xét nghiệm huyế t thanh học có thể phát hiện nhưng việc phát hiện CHIK-ARN trong mẫu bệnh phẩm vẫn cần được phát triển cải thiện. Nghiên cứu này mô tả kỹ thuật RT-PCR khuếch đại gen E1 của virut dùng chẩn đoán CHIKV-ARN. Bằng kỹ thuật này phát hiện 4 50 8 bệnh nhân BN SXH dương tính với CHIKV-ARN. Phân tích trình tự gen 4 mẫu này xác định độ tương đổng các nucleotide trên 93 so với các chủng CHIKV đã công bố. Từ khóa Số t xuấ t huyết Chikungunya. APPLYING THE RT-PCR ASSAY TO IDENTIFY CHIKUNGUNYA VIRUS IN HEMORRHAGIC FEVER PATIENTS SUMMARY Chikungunya virus CHIKV has recently caused hemorrhagic fever in Southeast Asian and African countries. Although serological test may be used however to examine CHIKV-RNA in sample still need to improvement. In this study we have descried a revert transcript RT -PCR assay targeting E1 gene of virus for diagnosis of CHIKV-RNA. In 4 50 8 blood samples of hemorrhagic fever patients were positive sample for CHIKV-RNA by RT-PCR assay. Sequencing analyzed for 4 sample patients demonstrated more than 93 homological nucleotides. Key words Hemorrhagic fever Chikungunya. ĐẶT VẤN ĐỀ Virut Chikungunya CHIKV thuộc nhóm Alphavirus họ Togaviridae. CHIKV gây các triệu chứng lâm sàng điển hình như đau khớp sốt và xuất huyết. Những triệu chứng lâm sàng này cũng thường thấy trên bệnh nhân nhiễm virut Onyong-nyong Virut Ross River Virut Barmah Forest và đặc biệt ở các nước Đông Nam châu Á và châu Phi thường giống với dengue xuất huyết. CHIKV là virut có cấu trúc ARN đơn kích thước khoảng 12 kb capsid và protein màng. CHIKV lần đầu tiên được phát hiện ở Tanzania Châu Phi . Sau đó virut phát triển gây dịch ở nhiều nước và các khu vực trên thế giới. Gần đây CHIKV gây
