Trong lịch sử phát triển của thực vật học thì giải phẫu hình thái được phát triển tương đối sớm. Hơn 2300 năm trước đây, Theophrastus (371- 286 TCN) lần đầu tiên đã đề cập đến các dẫn liệu về hình thái và cấu tạo của cơ thể thực vật trong các tác phẩm “Lịch sử thực vật”, | Lịch sử nghiên cứu giải phẫu hình thái thực vật Trong lịch sử phát triển của thực vật học thì giải phẫu hình thái được phát triển tương đối sớm. Hơn 2300 năm trước đây Theophrastus 371- 286 TCN lần đầu tiên đã đề cập đến các dẫn liệu về hình thái và cấu tạo của cơ thể thực vật trong các tác phẩm Lịch sử thực vật Nghiên cứu về cây cỏ . Ông đã chia các phần của cây ra rễ thân lá hoa quả. Đồng thời những kiến thức về giải phẫu cũng lần đầu tiên được đề cập đến sự tạo thành vòng hàng năm của gỗ và libe. Nhiều kiến thức về sự phân biệt trong cơ quan dinh dưỡng và cơ quan sinh sản cũng được trình bày trong tác phẩm của Theophrastus. Giải phẫu thực vật với phương pháp nghiên cứu của nó có liên quan chặt chẽ với những thành tựu của kính hiển vi. Năm 1660 nhờ R. Hook phát minh ra kính hiển vi nên vào năm 1672 Grew đã sáng lập môn Giải phẫu thực vật và cùng Malpighi xuất bản quyển Giải phẫu thực vật . Tournefort đã dựa vào đặc 3 điểm của tràng hoa chia thành 3 nhóm thực vật cánh rời cánh liền và không cánh. Trong khi John Jay đã dựa vào cấu tạo của phôi đặt cách phân chia thực vật một lá mầm và hai lá mầm. Lineaus đã đưa ra khái niệm về biến thái hình thái khi xem xét về nguồn gốc hoa lá chồi của thực vật. Dựa vào đó nhà tự nhiên học người Đức Goeth đã nâng lên thành học thuyết biến thái trong công trình Thử giải thích hiện tượng biến thái thực vật . Theo ông sự thích nghi của thực vật với tác động của môi trường dẫn đến biến thái. Giữa thế kỷ XIX các công trình nghiên cứu về thực vật có hạt đã lấp được hố ngăn cách giữa thực vật hạt trần và thực vật hạt kín đã xác định được qui luật chung trong chu trình sống của thực vật dưới hình thức xen kẽ thế hệ góp phần quan trọng trong việc giải thích sự tiến hoá của giới thực vật. Vào cuối thế kỷ XIX các nhà khoa học đã tìm ra mối liên quan giữa cấu .
