Ngành chỉ có một lớp Cryptophyceae. Lớp này gồm có 12 chi với khoảng 100 loài sống ở nước ngọt và 100 loài ở biển. Phần lớn đại diện của lớp có dạng đơn bào mang roi, mặc dù một số tảo ở một giai đoạn có cấu trúc tản dạng pamella hoặc dạng bất động dính vào giá thể (sessile). | Ngành Tảo có huyệt - Cryptophyta Ngành chỉ có một lớp Cryptophyceae. Lớp này gồm có 12 chi với khoảng 100 loài sống ở nước ngọt và 100 loài ở biển. Phần lớn đại diện của lớp có dạng đơn bào mang roi mặc dù một số tảo ở một giai đoạn có cấu trúc tản dạng pamella hoặc dạng bất động dính vào giá thể sessile . Chỉ có một chi Bjornbergiella có cấu trúc dạng sợi đơn giản. - Tế bào Tế bào mang hai roi không bằng nhau roi dài mang hai hàng lông ống mastigonemes roi ngắn mang một hàng lông tơ. Tế bào có cấu trúc lưng bụng mặt lưng lồi mặt bụng phẳng mang một rãnh dọc nông Hình . Mặt đỉnh tế bào cụt. Đỉnh trước của rãnh có một huyệt sâu với thành huyệt mang nhiều trychocyts. Hai roi mọc ra phía trên và quanh bên phải của huyệt. Sản phẩm quang hợp là tinh bột và nó được tích lũy trong vùng trống periplastidan giữa lưới nội sinh chất lục lạp và vỏ lạp. Tế bào thường không có điểm mắt. Ở những đại diện có điểm mắt thì điểm mắt ở dạng các giọt dầu. Tế bào được bao bởi màng protein chắc thường tạo nên các tấm dạng hình chữ nhật. Mặt ngoài của màng plasmalema được phủ bởi các tấm có cấu trúc tinh thể. 153 - Sinh sản Sinh sản hữu tính theo lối đẳng giao với chu trình sống đơn - lưỡng tướng hơi dị hình. Đây là kiểu chu trình sống trong đó gồm giai đoạn mang roi đơn bội xen kẽ với giai đoạn mang roi lưỡng bội. Phân bố Lớp tảo Cryptophyceae gặp ở cả môi trường nước ngọt và biển. Ngoài các loài sống tự dưỡng cũng gặp các loài sống dị dưỡng. Ở môi trường nước ngọt các đại diện tảo Cryptophyceae thường xuất hiện ở các ao nhỏ các vũng nước đọng đặc biệt ở những nơi giàu chất dinh dưỡng. Ở môi trường biển chúng hiện diện phổ biến ở các ao đầm vùng triều. Cryptophyta chiếm giữ một phần quan trọng trong thành phần nanoplankton tảo phù du có đường kính 2 - 20pm