Khi đặt vấn đề nghiên cứu về cơ chế xúc tác của enzyme người ta xuất phát từ giả thiết cho rằng trong các phản ứng được enzyme xúc tác, phức tạm thời “Enzyme – Cơ chất” được tạo thành. Quá trình này gồm 3 giai đoạn: quan tới việc phá vỡ hay hình thành các liên kết cộng hóa trị. Ở giai đoạn này, cơ chất được hoạt hóa (một hoặc vài phức chất ES chuyển tiếp được hoạt hóa). Ở đây, cấu trúc bậc 3 của enzyme luôn biến đổi E + S ES ES* E. | CƠ CHẾ XÚC TÁC CỦA ENZYME Khi đặt vấn đề nghiên cứu về cơ chế xúc tác của enzyme người ta xuất phát từ giả thiết cho rằng trong các phản ứng được enzyme xúc tác phức tạm thời Enzyme - Cơ chất được tạo thành. Quá trình này gồm 3 giai đoạn Ở giai đoạn 1 phản ứng xảy ra tương đối nhanh cơ chất S được liên kết với enzyme E nhờ các liên kết yếu. Lúc này sự liên kết không gian giữa các phân tử cơ chất và enzyme chưa đủ hiệu quả đối với sự xúc tác của enzyme. Ở giai đoạn tiếp theo xảy ra sự biến đổi của cơ chất S có liên quan tới việc phá vỡ hay hình thành các liên kết cộng hóa trị. Ở giai đoạn này cơ chất được hoạt hóa một hoặc vài phức chất ES chuyển tiếp được hoạt hóa . Ở đây cấu trúc bậc 3 của enzyme luôn biến đổi E S ES ES E P 1 2 3 46 tạo khả năng tiếp xúc giữa các nhóm hoạt động của enzyme với cơ chất đang biến đổi. Enzyme đã làm biến đổi phần tử cơ chất làm cho các liên kết bên trong phân tử trở nên lỏng lẻo hơn do đó chỉ cần một lượng năng lượng nhỏ cũng đủ làm cho cơ chất biến thành các sản phẩm P khác nhau. Người ta đã chứng minh rằng trong khi hình thành phức chất ES có 2 quá trình đồng thời xảy ra nhanh chóng đó là a Sự thay đổi mật độ điện tử gây nên sự phân cực hóa các liên kết. b Sự biến dạng về mặt hóa học của các liên kết kéo căng trong phân tử cơ chất. Cả hai yếu tố này sự biến hình và sự phân cực hóa các liên kết đồng hóa trị đều làm tăng thế năng nhiệt động học của các .
