Tham khảo tài liệu 'giáo trình tin - sinh học part 4', khoa học tự nhiên, công nghệ sinh học phục vụ nhu cầu học tập, nghiên cứu và làm việc hiệu quả | vị mã di truyền với các amino axit hay thông tin di truyền tương ứng được trình bày trong biểu đồ hình . Trong biểu đồ này thứ tự bộ ba nucleotide mã hoá cho amino axit tương ứng được đọc từ vòng tròn trong ra vòng tròn bên ngoài và cụm ký tự UAA UAG UGA đảm nhiệm vai trò tín hiệu kết thúc chuỗi. Hình . Biểu đồ xác định tnã di truyền Trình tự chuỗi polypeptide trên được gọi là cấu trúc bậc một của phân tử protein. Ở trạng thái tự nhiên chuỗi polymer này liên kết với nhau theo kiểu nhất định để hình thành cấu trúc xoắn đặc trưng a và cấu trúc p a- 47 helix và P-sheet - cấu trúc bậc hai . Các chuỗi a và p này cuộn xoắn lại trong không gian theo kiểu trật tự riêng của mỗi dạng protein tạo ra cấu trúc không gian bậc ba và phân tử protein bậc ba tiếp tục cuộn lại trong không gian hình thành cấu trúc bậc bốn. Cấu trúc bậc cao là dạng cấu trúc tự nhiên phổ biến của các phân tử protein và với phần lớn protein tự nhiên khi cấu trúc này bị phá vỡ sẽ kéo theo sự thay đổi lớn hay bị mất hoàn toàn chức năng sinh học cúa chúng. Sơ đồ nguyên lý dạng cấu trúc cơ sở của phân tử protein được mô tá trong hình . Hình . Mó hình cấu trúc xoắn protein 48 Như đã trình bày ớ phần trên cấu trúc chuồi xoắn kép DNA cơ quan mang thông tin di truyển cấu trúc phân tử protein quá trình tái bản DNA và quá trình sinh tổng hợp protein xảy ra theo cơ chê đặc thù và logic. Sử dụng các ký tự viết tắt tên các nucleotide và tên các amino axit người ta dễ dàng áp dụng công nghệ thông tin để mô phỏng và mó hình hoá các quá trình ấy nghĩa là có thể dẽ dàng sô hoá dể mô tả đặc tính tự nhiên của các vật liệu sinh học. Trên cơ sở này việc nghiên cứu so sánh xử lý dữ liệu và thiết kẻ mô phỏng chương trình nghiên cứu thực nghiệm có thể tiến hành một cách thuận lợi và hiệu quà hơn so với cách thức đã thực hiện theo cóng nghê cổ điển. . Nghiên cứu so sánh cấu trúc chuỗi So sánh cấu trúc chuỗi là kỹ thuật hay thuật toán để so sánh cấu trúc hai chuỗi pair-wise alignment hay so sánh đổng thời nhiều .
