Tham khảo tài liệu 'giáo trình tin - sinh học part 6', khoa học tự nhiên, công nghệ sinh học phục vụ nhu cầu học tập, nghiên cứu và làm việc hiệu quả | môi kích thước mồi hàm lượng GC trong thành phần khả năng bắt cặp dimer trị số nhiệt động và cấu trúc không gian bậc hai của đoạn mồi kích thước sản phẩm PCR. trên cơ sở dữ liệu phân tích của các đoạn mồi tương ứng đã biêt trong các ngân hàng dữ liệu. Giao diện trực tuyến của chương trình Primer3 có dạng như sau IBSsl c Me 3 Primer3 pick primers from a DNA sequence cautions FAQ Paste source sequence below 5 - 3 . string of ACGTNacgtn -- other letters treated as N -- numbers and blanks Ignored FASTA format ok Please N-out undesaable sequence vector. ALUs LINEs etc or use a MuprynmR_Llbl y_iiepeaLkk ry none disclaimer source code p r 17 Pick Pick Pick left hybridization right pnmer probe pnmer or internal or use oligo use left or right pnmer use primer below oligo below below 53 on opposite strand Excluded A string to identify your output Eg. 50 2 requires printers to surround the 2 bases at positions 50 and 51 Or mark the source sequence with and eg ATCT CCCC TCAT means that primers must flank the central cccc Eg 401 7 forbids selection of pnmers in the 7 bases starting at 401 and the 3 bases at 68 Or mark the source sequence with and eg ATCT CCCC TCAT forbids primers in the central cccc Product Size Ranges i 50-250 100-300 301-400 401-500 01 600 601 zoo O1-8S0 8S1-1000 Click here to mjn . L t ư t ĩlow to computationally intensive for ỲMT ferver Number To Return 1 Max 3 Stablfaty ÕÕ fwawrj General Printer Picking Conditions Pnmer Tin Max Self Complementarity 8 00 Max 3 Self Complementarity 3 00 Max N s ÌPfi4ẹ Tarast Esnạlty Fưst Base Index Salt Concentration p Liberal Base f Õ Set Inside Target Penalty to allow pnmers tnside ajargcl so o Annealing Ohgo Concentration Not the concentration of oligos in the reaction mix but of those annealing to template Show Debugging Info p Do not treat ambiguity codes in hbranes as consensus Other Per-Sequence Inputs Region tartQọdọn Position the beginning and end of the included legion e gm .
