Đối với các giống vật nuôi, có hai phương pháp bảo tồn nguồn gen đó là bảo tồn “in situ” nghĩa là chăn nuôi con vật trong điều kiện ngoại cảnh phù hợp nhằm sử dụng chúng một cách có hiệu quả trong hiện tại, đồng thời vẫn giữ được những đặc tính quý để có thể khai thác sử dụng trong tương lai. Phương pháp bảo tồn “ex situ” tương tự lưu giữ “ex situ”. | Đối với các giống vật nuôi có hai phương pháp bảo tổn nguồn gen đó là bảo tồn in situ nghĩa là chăn nuôi con vật trong điều kiện ngoại cảnh phù hợp nhằm sử dụng chúng một cách có hiệu quả trong hiện tại đồng thời vẫn giữ được những đặc tính quý để có thể khai thác sử dụng trong tương lai. Phương pháp bảo tồn ex situ tương tự lưu giữ ex situ . Sau đây chúng ta chỉ đề cập tới vấn đề bảo tồn in situ và bảo tồn ex situ đối với vật nuôi. Có thể nhận thấy ưu nhược điểm của hai phương pháp bảo tồn này như sau - Bảo tồn in situ đòi hỏi phải cung cấp đầy đủ các điều kiện chăn nuôi đối với một quần thể vật nuôi thức ăn chuồng trại chăm sóc. trong khi đó sản phẩm của chúng lại không phù hợp với nhu cầu của thị trường hiện tại vì vậy bảo tồn in situ là một biện pháp tốn kém. Ngược lại trong bảo tồn ex situ người ta chỉ cần bảo quản một lượng mẫu rất nhỏ ở nhiệt độ lạnh sâu những điều kiện này không đòi hỏi nhiều chi phí. - Trong quá trình bảo tồn in situ người ta buộc phải phải tiến hành chọn lọc vật nuôi điều này có thể gây ra những biến đổi di truyền trong quần thể vật nuôi và như vậy nguồn gen vật nuôi ít nhiều cũng sẽ bị thay đổi. Bảo tồn ex situ không gây ra biến đổi di truyền nếu như việc mẫu đem bảo quản là đặc trưng cho nguồn gen của giống vật nuôi. - Đàn vật nuôi bằng phương pháp bảo tồn in situ có thể bị các bất lợi của điều kiện sống hoặc bệnh tật đe doạ tuy nhiên trong quá trình chống chọi với những điều kiện bất lợi hoặc bệnh tật khả năng thích nghi và sức đề kháng bệnh của chúng lại được tăng cường. Những ảnh hưởng và khả năng này đều không xảy ra trong điều kiện bảo tồn ex situ . - Cuối cùng trong quá trình bảo tồn ex situ chỉ cần một sơ suất về quản lý của con người cũng đủ làm tiệt chủng giống đang bảo quản. Như vậy bảo tồn in situ tuy nhiều rủi ro hơn nhưng rủi ro xảy ra trong bảo tồn ex situ là cực kỳ nguy hiểm. Từ những đánh giá trên có thể thấy rằng hai phương pháp bảo tồn này có thể hỗ trợ cho nhau để bảo tồn một giống vật nuôi tốt nhất là cần tiến hành .
