Báo cáo tài liệu vi phạm
Giới thiệu
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
THỊ TRƯỜNG NGÀNH HÀNG
NÔNG NGHIỆP, THỰC PHẨM
Gạo
Rau hoa quả
Nông sản khác
Sữa và sản phẩm
Thịt và sản phẩm
Dầu thực vật
Thủy sản
Thức ăn chăn nuôi, vật tư nông nghiệp
CÔNG NGHIỆP
Dệt may
Dược phẩm, Thiết bị y tế
Máy móc, thiết bị, phụ tùng
Nhựa - Hóa chất
Phân bón
Sản phẩm gỗ, Hàng thủ công mỹ nghệ
Sắt, thép
Ô tô và linh kiện
Xăng dầu
DỊCH VỤ
Logistics
Tài chính-Ngân hàng
NGHIÊN CỨU THỊ TRƯỜNG
Hoa Kỳ
Nhật Bản
Trung Quốc
Hàn Quốc
Châu Âu
ASEAN
BẢN TIN
Bản tin Thị trường hàng ngày
Bản tin Thị trường và dự báo tháng
Bản tin Thị trường giá cả vật tư
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
NGÀNH HÀNG
NÔNG NGHIỆP, THỰC PHẨM
Gạo
Rau hoa quả
Nông sản khác
Sữa và sản phẩm
Thịt và sản phẩm
Dầu thực vật
Thủy sản
Thức ăn chăn nuôi, vật tư nông nghiệp
CÔNG NGHIỆP
Dệt may
Dược phẩm, Thiết bị y tế
Máy móc, thiết bị, phụ tùng
Nhựa - Hóa chất
Phân bón
Sản phẩm gỗ, Hàng thủ công mỹ nghệ
Sắt, thép
Ô tô và linh kiện
Xăng dầu
DỊCH VỤ
Logistics
Tài chính-Ngân hàng
NGHIÊN CỨU THỊ TRƯỜNG
Hoa Kỳ
Nhật Bản
Trung Quốc
Hàn Quốc
Châu Âu
ASEAN
BẢN TIN
Bản tin Thị trường hàng ngày
Bản tin Thị trường và dự báo tháng
Bản tin Thị trường giá cả vật tư
Thông tin
Tài liệu Xanh là gì
Điều khoản sử dụng
Chính sách bảo mật
0
Trang chủ
Khoa Học Tự Nhiên
Sinh học
Identification of differentially expressed genomic repeats in primary hepatocellular carcinoma and their potential links to biological processes and survival
Đang chuẩn bị liên kết để tải về tài liệu:
Identification of differentially expressed genomic repeats in primary hepatocellular carcinoma and their potential links to biological processes and survival
Thúy Kiều
208
14
pdf
Không đóng trình duyệt đến khi xuất hiện nút TẢI XUỐNG
Tải xuống
Hepatocellular carcinoma (HCC) is one of the deadliest cancers. Research on HCC so far primarily focused on genes and provided limited information on genomic repeats, which constitute more than half of the human genome and contribute to genomic stability. In line with this, repeat dysregulation was significantly shown to be pathological in various cancers and other diseases. In this study, we aimed to determine the full repeat expression profile of HCC for the first time. We utilised two independent RNA-seq datasets obtained from primary HCC tumours with matched normal tissues of 20 and 17 HCC patients, respectively. We quantified repeat expressions and analysed their differential expression. We also identified repeats that are cooperatively expressed with genes by constructing a gene coexpression network. | Turkish Journal of Biology Turk J Biol 2021 45 599-612 http journals.tubitak.gov.tr biology TÜBİTAK Research Article doi 10.3906 biy-2104-13 Identification of differentially expressed genomic repeats in primary hepatocellular carcinoma and their potential links to biological processes and survival 1 2 1 3 Gökhan KARAKÜLAH Cihangir YANDIM 1 İzmir Biomedicine and Genome Center İBG İzmir Turkey 2 İzmir International Biomedicine and Genome Institute İBG-İzmir Dokuz Eylül University İzmir Turkey 3 Department of Genetics and Bioengineering Faculty of Engineering İzmir University of Economics İzmir Turkey Received 05.04.2021 Accepted Published Online 19.06.2021 Final Version 18.10.2021 Abstract Hepatocellular carcinoma HCC is one of the deadliest cancers. Research on HCC so far primarily focused on genes and provided limited information on genomic repeats which constitute more than half of the human genome and contribute to genomic stability. In line with this repeat dysregulation was significantly shown to be pathological in various cancers and other diseases. In this study we aimed to determine the full repeat expression profile of HCC for the first time. We utilised two independent RNA-seq datasets obtained from primary HCC tumours with matched normal tissues of 20 and 17 HCC patients respectively. We quantified repeat expressions and analysed their differential expression. We also identified repeats that are cooperatively expressed with genes by constructing a gene coexpression network. Our results indicated that HCC tumours in both datasets harbour 24 differentially expressed repeats and even more elements were coexpressed with genes involved in various metabolic pathways. We discovered that two L1 elements L1M3b L1M3de were downregulated and a handful of HERV subfamily repeats HERV-Fc1-int HERV3-int HERVE_a-int HERVK11D-int HERVK14C-int HERVL18-int were upregulated with the exception of HERV1_LTRc which was downregulated. Various LTR elements LTR32 LTR9 LTR4 .
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
Identification and comparative analysis of differentially expressed miRNAs in leaves of two wheat (Triticum aestivum L.) genotypes during dehydration stress
Identification of differentially expressed genes by means of outlier detection
Identification of differentially expressed genes and pathways for intramuscular fat metabolism between breast and thigh tissues of chickens
Identification of monotonically differentially expressed genes for non-small cell lung cancer
Báo cáo sinh học: "GOGOT: a method for the identification of differentially expressed fragments from cDNA-AFLP data"
Báo cáo y học: "Improving identification of differentially expressed genes in microarray studies using information from public databases"
báo cáo khoa học: " Identification of differentially expressed genes induced by Bamboo mosaic virus infection in Nicotiana benthamiana by cDNA-amplified fragment length polymorphism"
báo cáo khoa học: " Identification of differentially expressed genes associated with semigamy in Pima cotton (Gossypium barbadense L.) through comparative microarray analysis"
báo cáo khoa học: " Identification of genes differentially expressed during interaction of resistant and susceptible apple cultivars (Malus × domestica) with Erwinia amylovora"
Global identification and analysis revealed differentially expressed lncRNAs associated with meiosis and low fertility in autotetraploid rice
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.