NĐTP do nhiễm vi sinh vật: Những sinh vật này rất nhỏ như vi khuẩn, siêu vi, ký sinh trùng, nấm mốc Siêu vi gây NĐTP thường có trong ruột người lây truyền qua tay, qua phân của người bệnh và người tiếp xúc trực tiếp với thực phẩm, hoặc sử dụng nước bị ô nhiễm vào chế biến thức ăn. Siêu vi có thể gây bệnh với một lượng rất nhỏ, còn ký sinh trùng thì các loại thường gặp là giun sán (trong thịt heo bò trùng xoắn dây, trùng xoắn, trong cá nước ngọt có nan trứng.
