Số liệu dòng chảy là cực kì quan trọng trong việc tính toán cân bằng nước, là sơ sở để xây dựng các công trình trữ nước, vận hành các công trình thủy lợi Tuy nhiên, cũng giống như nhiều địa phương khác, các lưu vực sông thuộc tỉnh Khánh Hòa có nguồn số liệu dòng chảy đo đạc rất hạn chế. Toàn tỉnh chỉ có duy nhất trạm thủy văn Đồng Trăng có số liệu dòng chảy đo đạc (từ năm 1983 tới nay), trong khi đó số trạm đo mưa trong tỉnh tương đối đầy đủ và.