Các phương pháp cho điểm phản ứng của cây với bệnh thay đổi theo sự biểu hiện của bệnh và phụ thuộc vào từng loại bệnh cụ thể và loài cây kí chủ. Thông thường người ta dùng hệ thống số hay chỉ số để cho điểm phản ứng của cây. | Cho điểm phản ứng với bệnh Các phương pháp cho điểm phản ứng của cây với bệnh thay đổi theo sự biểu hiện của bệnh và phụ thuộc vào từng loại bệnh cụ thể và loài cây kí chủ. Thông thường người ta dùng hệ thống số hay chỉ số để cho điểm phản ứng của cây. Các nhà bệnh cây có xu hướng quan sát sự có mặt của bệnh hơn là không có bệnh. Vì vậy điểm thấp nhất thường thể hiện mực bệnh thấp nhất hay kháng bệnh cao nhất. Để tạo điều kiện tính toán chỉ số chọn lọc trong chương trình chọn giống trình tự cho điểm đôi khi đảo ngược. Đối với những bệnh chỉ có thể phân thành hai lớp nhiễm bệnh và không nhiễm bệnh như thán thư ở cây cốc người ta thường tính toán chỉ số bệnh. Đối với các bệnh hại lá người ta sử dụng tỷ lệ mô không bị bệnh hay thang điểm dựa vào số lượng và sự phân bố của cây hoặc sự tổn thất về năng suất Hooker 1979 . Đối với một số bệnh virus có thể do tính kháng bệnh thông qua mức độ thiệt hại về năng suất do bệnh gây ra. Cây bệnh và cây khoẻ của các giống kháng chịu có năng suất tương đương nhau. Đối với bệnh gỉ sắt sương mai và bệnh khác kiểu nhiễm bệnh thay đổi theo các giống khác nhau. Cây kháng có các điểm biến màu hay hoại tử nhỏ cây cảm nhiễm có vết bệnh lớn hơn tạo điều kiện thuận lợi cho sự sinh trưởng và sinh sản của thể gây bệnh. Ở một số trường hợp cây kháng duy trì trạng thái khoẻ mạnh lâu hơn cây cảm nhiễm mặc dù cuối cùng cả hai đều có mức bệnh như nhau. Một số thể gây bệnh tạo ra độc tố gây bệnh đặc thù như nấm Helminthosporium maydis chủng T ở ngô và ở mía. Có thể đánh giá tính kháng của các kiểu gen thông qua xử lý bằng độc tố đặc trưng do kí sinh tạo ra. Độc tố tạo ra phản ứng trên bộ phận của cây được thử nghiệm tương tự như thể gây .
