Đang chuẩn bị liên kết để tải về tài liệu:
Đánh giá đa dạng vi khuẩn có khả năng phân hủy cellulose và hemicellulose trong ruột mối coptotermes gestroi cư trú tại miền Bắc Việt Nam

Nghiên cứu trình bày 2.131 ORF (2,12%) thuộc 24 loài vi khuẩn (chiếm 1,75% tổng số loài vi khuẩn) thuộc 11 họ, 9 bộ, 8 lớp và 5 ngành có khả năng sinh cellulase, 679 ORF thuộc 18 loài vi khuẩn nằm trong 8 họ, 6 bộ, 5 lớp, 4 ngành được dự đoán có khả năng sinh hemicellulase. Số loài có khả năng sinh cellulase chủ yếu thuộc ngành Firmicutes (15/24 loài), phần lớn thuộc lớp Clostridia, bộ Clostridiales. Loài chiếm ưu thế nhất có khả năng sinh cellulase là Pseudomonas fluorescens (1.258 ORF) thuộc bộ Pseudomonadaceae. | Tạp chí Công nghệ Sinh học 17 3 537-544 2019 ĐÁNH GIÁ ĐA DẠNG VI KHUẨN CÓ KHẢ NĂNG PHÂN HỦY CELLULOSE VÀ HEMICELLULOSE TRONG RUỘT MỐI COPTOTERMES GESTROI CƯ TRÚ TẠI MIỀN BẮC VIỆT NAM Nguyễn Thị Thảo1 Đỗ Thị Huyền2 Trương Nam Hải2 1 Trường Đại học Vinh Nghệ An 2 Viện Công nghệ sinh học Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam Người chịu trách nhiệm liên lạc. E-mail tnhai@ibt.ac.vn Ngày nhận bài 10.6.2019 Ngày nhận đăng 26.9.2019 TÓM TẮT Ở các loài mối bậc thấp như Coptotermes gestroi cellulose và hemicellulose được thủy phân bởi cellulase và hemicellulase từ vi khuẩn vi khuẩn cổ động vật nguyên sinh và nấm sống ở ruột sau trong ống tiêu hóa của mối. Trong đó enzyme thủy phân chủ yếu được tiết ra bởi động vật nguyên sinh. Từ bộ dữ liệu trình tự DNA đa hệ gen vi sinh vật ruột mối C. gestroi thu thập ở miền Bắc Việt Nam 125.423 khung đọc mở - open reading frame- ORF và bằng phần mềm MEGA 100.340 ORF được dự đoán có nguồn gốc từ 1.368 loài vi khuẩn gồm 628 chi 217 họ 97 bộ 41 lớp và 22 ngành Do et al. 2014 . Trong số này 2.131 ORF 2 12 thuộc 24 loài vi khuẩn chiếm 1 75 tổng số loài vi khuẩn thuộc 11 họ 9 bộ 8 lớp và 5 ngành có khả năng sinh cellulase 679 ORF thuộc 18 loài vi khuẩn nằm trong 8 họ 6 bộ 5 lớp 4 ngành được dự đoán có khả năng sinh hemicellulase. Số loài có khả năng sinh cellulase chủ yếu thuộc ngành Firmicutes 15 24 loài phần lớn thuộc lớp Clostridia bộ Clostridiales. Loài chiếm ưu thế nhất có khả năng sinh cellulase là Pseudomonas fluorescens 1.258 ORF thuộc bộ Pseudomonadaceae. Trong 18 loài sinh hemicellulase loài chiếm ưu thế nhất là Clostridium thermocellum 113 ORF thuộc ngành Firmicutes sau đó là 3 loài thuộc ngành Bacteroidetes. Các vi khuẩn có khả năng phân hủy cả cellulose hemicellulose được ước đoán là C. thermocellum Ruminococcus flavefaciens và Bacillus subtilis. Kết quả nghiên cứu này đã góp phần cung cấp dữ liệu về thành phần của vi khuẩn phân hủy cellulose và hemicellulose sống trong đường ruột mối C. gestroi. Từ khóa Coptotermes gestroi