Báo cáo tài liệu vi phạm
Giới thiệu
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Sức khỏe - Y tế
Văn bản luật
Nông Lâm Ngư
Kỹ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
THỊ TRƯỜNG NGÀNH HÀNG
NÔNG NGHIỆP, THỰC PHẨM
Gạo
Rau hoa quả
Nông sản khác
Sữa và sản phẩm
Thịt và sản phẩm
Dầu thực vật
Thủy sản
Thức ăn chăn nuôi, vật tư nông nghiệp
CÔNG NGHIỆP
Dệt may
Dược phẩm, Thiết bị y tế
Máy móc, thiết bị, phụ tùng
Nhựa - Hóa chất
Phân bón
Sản phẩm gỗ, Hàng thủ công mỹ nghệ
Sắt, thép
Ô tô và linh kiện
Xăng dầu
DỊCH VỤ
Logistics
Tài chính-Ngân hàng
NGHIÊN CỨU THỊ TRƯỜNG
Hoa Kỳ
Nhật Bản
Trung Quốc
Hàn Quốc
Châu Âu
ASEAN
BẢN TIN
Bản tin Thị trường hàng ngày
Bản tin Thị trường và dự báo tháng
Bản tin Thị trường giá cả vật tư
Tìm
Danh mục
Kinh doanh - Marketing
Kinh tế quản lý
Biểu mẫu - Văn bản
Tài chính - Ngân hàng
Công nghệ thông tin
Tiếng anh ngoại ngữ
Kĩ thuật công nghệ
Khoa học tự nhiên
Khoa học xã hội
Văn hóa nghệ thuật
Y tế sức khỏe
Văn bản luật
Nông lâm ngư
Kĩ năng mềm
Luận văn - Báo cáo
Giải trí - Thư giãn
Tài liệu phổ thông
Văn mẫu
NGÀNH HÀNG
NÔNG NGHIỆP, THỰC PHẨM
Gạo
Rau hoa quả
Nông sản khác
Sữa và sản phẩm
Thịt và sản phẩm
Dầu thực vật
Thủy sản
Thức ăn chăn nuôi, vật tư nông nghiệp
CÔNG NGHIỆP
Dệt may
Dược phẩm, Thiết bị y tế
Máy móc, thiết bị, phụ tùng
Nhựa - Hóa chất
Phân bón
Sản phẩm gỗ, Hàng thủ công mỹ nghệ
Sắt, thép
Ô tô và linh kiện
Xăng dầu
DỊCH VỤ
Logistics
Tài chính-Ngân hàng
NGHIÊN CỨU THỊ TRƯỜNG
Hoa Kỳ
Nhật Bản
Trung Quốc
Hàn Quốc
Châu Âu
ASEAN
BẢN TIN
Bản tin Thị trường hàng ngày
Bản tin Thị trường và dự báo tháng
Bản tin Thị trường giá cả vật tư
Thông tin
Tài liệu Xanh là gì
Điều khoản sử dụng
Chính sách bảo mật
0
Trang chủ
Luận Văn - Báo Cáo
Báo cáo khoa học
Báo cáo sinh học: " Estimation of alternative splicing isoform frequencies from RNA-Seq data"
Đang chuẩn bị liên kết để tải về tài liệu:
Báo cáo sinh học: " Estimation of alternative splicing isoform frequencies from RNA-Seq data"
Hào Nghiệp
74
13
pdf
Không đóng trình duyệt đến khi xuất hiện nút TẢI XUỐNG
Tải xuống
Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về sinh học được đăng trên tạp chí y học Molecular Biology cung cấp cho các bạn kiến thức về ngành sinh học đề tài: Estimation of alternative splicing isoform frequencies from RNA-Seq data. | Nicolae et al. Algorithms for Molecular Biology 2011 6 9 http www.almob.Org content 6 1 9 AMR ALGORITHMS FOR MOLECULAR BIOLOGY RESEARCH Open Access Estimation of alternative splicing isoform frequencies from RNA-Seq data Marius Nicolae1 Serghei Mangul2 Ion I Măndoiu1 and Alex Zelikovsky2 Abstract Background Massively parallel whole transcriptome sequencing commonly referred as RNA-Seq is quickly becoming the technology of choice for gene expression profiling. However due to the short read length delivered by current sequencing technologies estimation of expression levels for alternative splicing gene isoforms remains challenging. Results In this paper we present a novel expectation-maximization algorithm for inference of isoform- and genespecific expression levels from RNA-Seq data. Our algorithm referred to as IsoEM is based on disambiguating information provided by the distribution of insert sizes generated during sequencing library preparation and takes advantage of base quality scores strand and read pairing information when available. The open source Java implementation of IsoEM is freely available at http dna.engr.uconn.edu software IsoEM . Conclusions Empirical experiments on both synthetic and real RNA-Seq datasets show that IsoEM has scalable running time and outperforms existing methods of isoform and gene expression level estimation. Simulation experiments confirm previous findings that for a fixed sequencing cost using reads longer than 25-36 bases does not necessarily lead to better accuracy for estimating expression levels of annotated isoforms and genes. Background Ubiquitous regulatory mechanisms such as the use of alternative transcription start and polyadenylation sites alternative splicing and RNA editing result in multiple messenger RNA mRNA isoforms being generated from a single genomic locus. Most prevalently alternative splicing is estimated to take place for over 90 of the multi-exon human genes across diverse cell types 1 with as much as 68
TÀI LIỆU LIÊN QUAN
Báo cáo khoa hoc:" Comparison between estimation of breeding values and fixed effects using Bayesian and empirical BLUP estimation under selection on parents and missing "
Báo cáo sinh học: "Pattern statistics on Markov chains and sensitivity to parameter estimation"
Báo cáo sinh học: " Estimation of alternative splicing isoform frequencies from RNA-Seq data"
Báo cáo sinh học: " Sparse estimation for structural variability"
Báo cáo sinh học: "Genomic breeding value estimation using nonparametric additive regression models"
Báo cáo sinh học: "Estimation of prediction error variances via Monte Carlo sampling methods using different formulations of the prediction error variance"
Báo cáo sinh học: "Estimation in a multiplicative mixed model involving a genetic relationship matrix"
Báo cáo sinh học: " Genetic heterogeneity of residual variance estimation of variance components using double hierarchical generalized linear models"
Báo cáo sinh học: " Prediction of haplotypes for ungenotyped animals and its effect on marker-assisted breeding value estimation"
Báo cáo sinh học: "Quantitative estimation of genetic risk for atypical scrapie in French sheep and potential consequences of the current breeding programme for resistance to scrapie on the risk of atypical scrapie"
Đã phát hiện trình chặn quảng cáo AdBlock
Trang web này phụ thuộc vào doanh thu từ số lần hiển thị quảng cáo để tồn tại. Vui lòng tắt trình chặn quảng cáo của bạn hoặc tạm dừng tính năng chặn quảng cáo cho trang web này.