Đang chuẩn bị liên kết để tải về tài liệu:
Nghiên cứu tương tác và khai thác dữ liệu biểu hiện giữa các tiểu phần của yếu tố nhân y ở loài đậu gà (Cicer arietinum)

Thanh Thu 77 6 .pdf

Không đóng trình duyệt đến khi xuất hiện nút TẢI XUỐNG Tải xuống

Nghiên cứu về tương tác protein và mức độ biểu hiện của gen mã hóa protein đích được xem là những công cụ hỗ trợ đắc lực cho việc đưa ra giả thuyết về chức năng của gen. Trong nghiên cứu này, khả năng tương tác giữa ba tiểu phần của nhân tố phiên mã Yếu tố nhân Y (NF-Y) và mức độ biểu hiện của các gen mã hóa đã được phân tích trên cây đậu gà (Cicer arietinum). | Nghiên cứu tương tác và khai thác dữ liệu biểu hiện giữa các tiểu phần của yếu tố nhân y ở loài đậu gà (Cicer arietinum) ISSN: 1859-2171 TNU Journal of Science and Technology 225(01): 11 - 16 e-ISSN: 2615-9562 NGHIÊN CỨU TƯƠNG TÁC VÀ KHAI THÁC DỮ LIỆU BIỂU HIỆN GIỮA CÁC TIỂU PHẦN CỦA YẾU TỐ NHÂN Y Ở LOÀI ĐẬU GÀ (Cicer arietinum) Chu Đức Hà1, Lê Thị Ngọc Quỳnh2* 1Viện Khoa học Nông nghiệp Việt Nam, 2Đại học Thủy lợi TÓM TẮT Nghiên cứu về tương tác protein và mức độ biểu hiện của gen mã hóa protein đích được xem là những công cụ hỗ trợ đắc lực cho việc đưa ra giả thuyết về chức năng của gen. Trong nghiên cứu này, khả năng tương tác giữa ba tiểu phần của nhân tố phiên mã Yếu tố nhân Y (NF-Y) và mức độ biểu hiện của các gen mã hóa đã được phân tích trên cây đậu gà (Cicer arietinum). Kết quả mô hình hóa interactome đã cho thấy tiểu phần CaNF-YB có thể kết hợp chặt chẽ với CaNF-YC thành dạng nhị hợp, sau đó tương tác với CaNF-YA tạo thành phức hợp CaNF-Y hoàn chỉnh, tương tự như ở các loài thực vật khác. Trong đó, bốn dạng kết hợp của ba tiểu phần đã được dự đoán là [(CaNF-YB19/-YC01)/-YA06], [(CaNF-YB19/-YC01)/-YA02], [(CaNF-YB18/-YC01)/-YA06] và [(CaNF-YB18/-YC01)/-YA02]. Tiếp theo, cấu trúc vùng bảo thủ của các tiểu phần CaNF-YA có tương tác đều chứa hai vùng riêng biệt, là đoạn nhận biết, bám DNA và đoạn tương tác với cấu trúc CaNF-YB/YC. Cấu trúc vùng bảo thủ của các tiểu phần CaNF-YB và -YC có tương tác được ghi nhận với hai vùng tương tác với CaNF-YA và với CaNF-YC hoặc CaNF-YB. Khai thác dữ liệu phiên mã trước đây đã chỉ ra rằng các gen mã hóa tiểu phần CaNF-Y có tương tác đều thể hiện mức độ biểu hiện mạnh ở ít nhất một vị trí trong cây. Kết quả của nghiên cứu này đã gợi mở những dẫn liệu .

TÀI LIỆU LIÊN QUAN