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Báo cáo toán học: "A distance measure between plant architectures"

Tuyển tập các báo cáo nghiên cứu về lâm nghiệp được đăng trên tạp chí lâm nghiệp quốc tế đề tài: A distance measure between plant architectures. | 445 Ann. For. Sci. 57 2000 445-461 INRA EDP Sciences Original article A distance measure between plant architectures Pascal Ferraro and Christophe Godin Plant Modelling Program - CIRAD Programme de modélisation des plantes TA 40E 34398 Montpellier Cedex 5 France Received 1 February 1999 accepted 18 February 2000 Abstract - In many biological fields e.g. horticulture forestry botany a need exists to quantify different types of variability within a set of plants. In this paper we propose a method to compare plant individuals based on a detailed comparison of their architectures. The core of the method relies on an adaptation of an algorithm for comparing rooted tree graphs recently proposed by Zhang in theoretical computer science. Using this algorithm a distance between two plants is defined as the cost of transforming one into the other using basic edit operations . We illustrate this method in three application fields and then compare it with other methods for quantifying plant similarity. topological structure of plants plant comparison analytical method Résumé - Definition d une distance entre architectures de plantes. Dans de nombreux domaines de la biologie arboriculture sylviculture botanique il est nécessaire d étudier différents types de variabilité au sein d une population de plantes. Nous propo-sons dans ce papier une méthode de comparaison des plantes basée sur une comparaison détaillée de leur architecture. Cette métho-de est une adaptation d un algorithme de comparaison d arborescences proposé récemment par Zhang en informatique théorique. Cet algorithme nous permet de définir une distance entre deux plantes comme le cout de la transformation de l une en l autre à l aide d opérations élémentaires d édition . Cette méthode est illustrée dans trois domaines d application et elle est comparée à d autres méthodes de quantification de la ressemblance entre plantes. structure topologique des plantes comparaison des plantes méthode analytique 1. INTRODUCTION