Đang chuẩn bị liên kết để tải về tài liệu:
Giáo trình Tin - Sinh học part 8

Tham khảo tài liệu 'giáo trình tin - sinh học part 8', khoa học tự nhiên, công nghệ sinh học phục vụ nhu cầu học tập, nghiên cứu và làm việc hiệu quả | Tiếp theo nhấn chọn vào một trong hai đường dẫn siêu liên kết 2BES hay MMDB phía bên phái dòng tin . Sau đó chương trình tìm kiếm cấu trúc Entrez Structure sẽ phản hồi lại kết-quả với dạng giao diện như sau NCBI MMDB structure Summary OMIM PubMed BLAST Structure Taxonomy Help Cn3d Description Structure Of Mycobacterium Tuberculosis Ribose-5-Phosphate Isomerase. Rpib Rv2465c In Complex With 4-Phospho-D- Erythronohydroxamic Acid- Deposition A K Roos. D J Encsson S.L Mowbray 8-NOV-04 Taxonomy Mycobacterium tuberculosis Reference PubMed MMDB 31192 PDB 2BES View 3D Structure I 0 I Best Model with Cn3D 3 I Display 3 Get Cn3D 4. 1 1 20 40 60 SO too 120 140 160 172 Protein 3d Donains Protein 1 20 40 60 80 100 120 140 160 172 3d Ponains 1 20 40 60 80 100 120 140 160 172 Protein 3d Donains Hình 8.2. Giao diện thông tin cáu trúc tóm tắt của 2BES Từ trên giao diện kết quả này nhấn chọn lệnh View 3D Structure chương trình Cn3D sẽ phản hồi lại hiển thị cấu trúc không gian ba chiều cúa 2BES như hình 8.3. 2BĨS_B mahhhhhhígmĩgmrvylgadhagye 1 k q I I uhlkqtghepidcgilrydidddypafc 1 a a 2BES_C mahhhhhhsgtnsgmrvylgadhígye 1 k q r I lehlkqtghepidcgilrydidddypifc 1 a a a t r t V a d 2BBS_D mahhhhhhsgmsgmrvylgadhagyelkqiiiehlkqtghepidcgalrydadddypafciaaatrtvad 2BES_E mahhhhhhsgtnsgmrvylgadhagye 1 k q ĩ I lehlkqtghepidcgalrydadddypafciaaatrtvad Hình 8.3. Cấu trúc không gian ba chiếu của alpha amylase 2BES 107 8.2.2. Từ dịch vụ entrez sequence neighbor Trong trường hợp này giả sử người phân tích cần tìm hiểu cấu trúc các protein có quan hệ gần gũi với 1 4-alpha amylase. Sử dụng chương trình tìm kiếm Entrez trong http www.ncbi.nlm.nih.gov với chủ đề Protein và tỉr khoá alpha amylase chương trình tìm kiếm trực tuyến sẽ phán hồi lại kết quả với dạng giao diện như trong hình 8.4. Hình 8.4. Giao diện hiển thị kết quả tìm kiếm nhóm protein alpha amylase trong Medline Tiếp theo nhân vào đường dẫn siêu liên kết Blink ở góc trên bên phải của nhóm 4-alpha-glucan branching enzyme . Sau đó lại vào tiếp