Mục tiêu của môn học Kế toán đơn vị sự nghiệp nhằm trang bị nền tảng kiến thức cơ bản về kế toán các đơn vị thuộc lĩnh vực kế toán công, cung cấp kiến thức toàn diện về kế toán của đơn vị có sử dụng và không sử dụng ngân sách nhà nước, giúp cho sinh viên hiểu biết về công cụ quản lý ngân sách.