Đa dạng di truyền ngan xám dựa vào trình tự nucleotide trên vùng gen Cytochrome B ty thể

Bài viết Đa dạng di truyền ngan xám dựa vào trình tự nucleotide trên vùng gen Cytochrome B ty thể bước đầu khảo sát đa dạng di truyền nucleotide thuộc trình tự vùng gen Cytochrome b thuộc ty thể của ngan Xám Tây Nguyên nuôi tại Đồng Nai. | DI TRUYỀN DI TRUYỀN - GIỐNG VẬT NUÔI - GIỐNG VẬT NUÔI ĐA DẠNG DI TRUYỀN NGAN XÁM DỰA VÀO TRÌNH TỰ NUCLEOTIDE TRÊN VÙNG GEN CYTOCHROME B TY THỂ Nguyễn Thị Lan Anh1 Lê Tấn Lợi2 Đỗ Thế Anh1 Nguyễn Thị Khánh Ly2 Nguyễn Thị Thủy Tiên1 và Hoàng Tuấn Thành1 Ngày nhận bài báo 18 11 2021 - Ngày nhận bài phản biện 01 12 2021 Ngày bài báo được chấp nhận đăng 02 12 2021 TÓM TẮT Mục tiêu của nghiên cứu này nhằm bước đầu khảo sát đa dạng di truyền nucleotide thuộc trình tự vùng gen Cytochrome b thuộc ty thể của ngan Xám Tây Nguyên nuôi tại Đồng Nai. Cặp mồi được thiết kế để khuếch đại đoạn gen mục tiêu có kích thước khoảng 546bp. Kết quả phân tích 49 mẫu cá thể gồm 29 cá thể ngan Xám 10 ngan trắng thuần Pháp và 10 mẫu cá thể ngan lai với kích thước khoảng 506bp cho thấy trung bình các loại nucleotide Adenine A 25 62 Thymine T 24 63 Cy- tosine C 34 49 Guanine G 15 26 và chỉ số đa dạng nucleotide p là . Có 58 vị trí biến đổi đa hình nucleotide 18 haplotype đã được quan sát với chỉ số đa dạng haplotype Hd là 0 618 0 0067 và haplotype 1 là trội. Khoảng cách di truyền giữa ngan Xám và ngan Pháp thuần là lớn nhất 0 0103 thấp hơn là giữa nhóm ngan Xám và ngan lai 0 0095 và thấp nhất là giữa nhóm ngan lai và ngan Pháp thuần 0 0014 . Kết quả cây di truyền đã cho thấy nhóm ngan Xám đã phân thành hai nhánh. Trong nhánh lớn tập trung hầu hết các cá thể ngan Xám ngan lai và ngan Pháp thuần và nhóm này có quan hệ di truyền gần với nhóm ngan châu Mỹ và Ấn Độ. Một số cá thể ngan Xám có màu lông trắng cũng tách ra thành các nhóm phụ riêng biệt trong nhánh lớn này. Một nhánh khác nhỏ hơn bao gồm một số cá thể ngan Xám có màu lông trắng và sau đó cũng tách ra các nhóm phụ. Ngan Xám có quan hệ gần với nhóm ngan châu Mỹ và Ấn Độ. Việc tăng dung lượng mẫu mở rộng địa bàn thu nhận để phân tích là điều cần thiết cho nghiên cứu tiếp theo.