Các enzym giới hạn cắt ADN kép ở các vị trí đặc hiệu ngoài hoặc trong trình tự nucleotid đ-ợc nhận ra và để lại 3 dạng các đầu tận cùng: phẳng; chéo có ADN đơn 3’ thừa, chéo có ADN đơn 5’ thừa. Nghiên cứu này dùng một ph-ơng pháp cho phép xác định kiểu cắt của các enzym giới hạn. Ph-ơng pháp trình tự Sanger đ-ợc sử dụng để phân tích ADN ở xung quanh vị trí cắt nh-ng dùng chất không phóng xạ. Song song các đoạn ADN tổng hợp kéo dài đ-ợc cắt bằng enzym.